Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms