Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms