Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms