Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpa6Q5U901 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpa6Q5U901 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms