Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms