Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms