Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm11487Q5RIS0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm11487Q5RIS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11487Q5RIS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms