Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms