Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms