Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms