Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trp53i11Q4QQM4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trp53i11Q4QQM4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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