Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms