Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms