Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms