Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap65Q3V0B4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap65Q3V0B4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms