Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms