Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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