Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap1Q3UUV5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms