Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230104I21RikQ3USW4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms