Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec31aQ3UPL0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms