Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Arhgef40Q3UPH7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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