Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms