Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms