Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp19Q3UJD6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms