Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms