Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms