Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms