Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms