Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms