Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TraddQ3U0V2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms