Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms