Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms