Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh5Q3TSG4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms