Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c3Q3TMP1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms