Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms