Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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