Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms