Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prr27Q3SYJ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prr27Q3SYJ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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