Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3KNL4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3KNL4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3KNL4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3KNL4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms