Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms