Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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Shroom4Q1W617 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shroom4Q1W617 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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