Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Samd11Q1RNF8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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