Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cpne9Q1RLL3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Cpne9Q1RLL3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cpne9Q1RLL3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cpne9Q1RLL3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cpne9Q1RLL3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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