Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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