Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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