Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rpusd3Q14AI6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rpusd3Q14AI6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rpusd3Q14AI6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rpusd3Q14AI6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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