Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms