Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms