Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms