Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tmem52bQ0VBF2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tmem52bQ0VBF2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms